Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms