Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTERF3Q96E29 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms