Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms