Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms