Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms