Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAVIN3Q969G5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms