Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF1Q92879 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms