Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRUQ92729 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms