Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN4Q92575 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms