Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms