Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL22A1Q8NFW1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL22A1Q8NFW1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms