Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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