Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms