Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC112Q8NEF3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms