Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms