Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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