Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms