Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSAMQ8N6F7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSAMQ8N6F7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms