Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms