Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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