Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PROM2Q8N271 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms