Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHERPQ8IWX8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms