Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC4Q7Z404 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms