Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE3BQ7Z3V4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3BQ7Z3V4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms