Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms