Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13LQ71F56 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms