Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZRN4Q6ZMN7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZRN4Q6ZMN7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms