Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms