Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms