Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBR1LQ6UX01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBR1LQ6UX01 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms