Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUX4L9Q6RFH8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms