Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms