Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZKSCAN2Q63HK3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms