Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD13Q5VXD3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms