Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EFCAB2Q5VUJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFCAB2Q5VUJ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms