Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF38BQ5VTL8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRPF38BQ5VTL8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms