Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms