Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf220Q5T0J3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms