Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms