Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms