Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD55Q3KP44 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms