Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC57Q2TAC2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms