Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ISXQ2M1V0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms