Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms