Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPROQ16827 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms