Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ME3Q16798 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME3Q16798 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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