Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CA9Q16790 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CA9Q16790 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms