Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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FOXD1Q16676 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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