Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CTF1Q16619 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTF1Q16619 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CTF1Q16619 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CTF1Q16619 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTF1Q16619 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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