Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF239Q16600 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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